가장 좋은 생물 정보학 에 Linux

메이크업 등의 시스템을 구축 자주 예를 들어 복잡한 워크 플로우를 생성하는 데 사용됩니다 . 생물 정보학 & NBSP에, snakemake 함께 빠르고 편안하게 실행 환경, 파이썬 스타일의 깨끗하고 현대적인 도메인 특정 사양 언어 (DSL)를 제공하여 워크 플로를 만들 수의 복잡성을 감소시키기 위하여 제정되었습니다.설치- 우분투 12.04에, 당신은 우리의 런치 패드 저장소에 사용할 수있는 데비안 패키지 python3-snakemake를 설치할 수...

CLC DNA 작업대 고급 DNA 서열의 다수를 만들 수 있으므로 사용자는 소프트웨어의 환경을 조성 분석, 매끄러운 데이터 관리 및 우수한 그래픽보기 및 출력 옵션과 결합.CLC DNA Workbench는 Windows, Mac OS X 및 Linux 플랫폼에서 사용할 수 있습니다 특징 :. 생물 정보학은 유전자 워크 벤치의 기능 :원형 분자의 유연한보기.그래픽 및 알고리즘 고급 프라이머 디자인을위한 편집기DNA 시퀀스 데이터의 어셈블리분자...

seriesoftubes는 Solexa 칩 서열 데이터에 대한 확장 파이프 라인이다.패키지 문서 요구 사항 :...

STEME 프로젝트는 MEME 등의 주제 측정기에 사용되는 모델의 유형에 대한 기대 - 극대화, 알고리즘에 근사치로 생활을 시작했다.STEME 및 다른 URL;의 EM 근사 배 정도 더 빨리보다 일반적인 매개 변수 설정에 대한 MEME 구현을 실행합니다. STEME는 이제 그 자체로 제몫을 모티브 찾기로 발전하고있다.왜 STEME를 사용합니까?검증 된 모티브 발견 기술STEME은 시험하려고 앤 MEME 알고리즘에 기초한다. MEME는 가장 성숙하고...

Genepidgin 평가 및 대입 유전자 제품 이름에 도움이 파이썬 도구입니다 & NBSP; 세 가지 주요 구성 요소가 있습니다. :genepidgin * 청소기 *& NBSP는; UNIPROT 명명 지침에 따라 유전자 이름을 표준화genepidgin * 비교 *& NBSP에서는 유전자 이름 둘 이상의 집합을 비교genepidgin * 선택 *& NBSP; 동성 증거 격의에서 가장 적절한 제품 이름을 선택현재의 개발 상태를 포함 자세한 내용은,...

MISO (이성체의 혼합물)의 발현 수준 & NBSP을 quantitates 파이썬으로 작성된 확률 프레임 워크이다 RNA-SEQ 데이터로부터 선택적으로 접합 유전자의 샘플을 통해 차별적 규제 동종 또는 엑손를 식별합니다.RNA-SEQ의 이성체로부터 생성되는 판독함으로써 생성 적 프로세스를 모델링함으로써, MISO 모델 판독이 특정 이성체에 유래하는 확률을 계산하기 위해 베이 즈 추론을 사용한다.MISO 대체 mRNA의 동종의 기본 세트의 풍부함을...

Pathomx (이전 MetaPath)는 시각화 및 GNU / Linux와 다른 POSIX & NBSP에서 대사 데이터의 분석을위한 대화 형 유틸리티 역할을 바닥부터 설계 IPython, Qt를하고 PyQt는 구현 된 오픈 소스 그래픽 소프트웨어입니다 운영 시스템. 그것은 처음 가져 오기 및 NMR 정상화, 비닝 (binning) 및 정렬뿐만 아니라 대사 경로 시각화 및 광산을 포함하여 (핵 자기 공명) 데이터, 스펙트럼 처리, 수출에 대한 지원을 포함...

는 버로우즈 - 휠러 얼 라이너 (BWA)는 예컨대 인간 게놈으로 긴 레퍼런스 시퀀스에 대해 상대적으로 짧은 뉴클레오티드 서열 정렬 효율적인 프로그램이다.이 소프트웨어는 두 알고리즘, BWA-짧고 BWA-SW를 구현합니다. 쿼리에 대한 이전의 작품은 200bp보다 짧은 주위 100kbp까지 긴 시퀀스에 대한 후자의 시퀀스.두 알고리즘 모두는 갭 첨부 정렬을한다. 그들은 일반적으로보다 정확하고 빠른 낮은 오류율 쿼리에 있습니다. 자세한 내용은 BWA...

avalanchetoolbox 식별하고 같은 신경 눈사태로 분기 프로세스를 설명하기위한 도구입니다 이 요구 사항 : 있습니다. ...

는 OpenElectrophy 조작, 저장 및 전기 생리 데이터의 분석을 용이하게하기위한 프레임 워크이다. 그것은 많은 다른 파일 형식에서 데이터를 가져올 단일 SQL 형 데이터베이스에 저장할 수 있습니다.OpenELectrophy에 포함 된 분석 툴은 진동 감지 및 검출 스파이크이다. 또한 분석은 쓸 수 있지만 OpenElectrophy 매우 데이터베이스 및 조작에 유용한 데이터의 질의를 용이하게 클래스와 함수의 라이브러리를 제공합니다. 스크립트...