상단 생물 정보학 에 Linux

Ghemical는 GNU GPL 아래 계산 화학 소프트웨어 패키지입니다. 이 패키지의 전체 소스 코드를 사용할 수 있으며, 사용자가 공부하고 패키지를 자유롭게 변경할 수 있음을 의미한다. Ghemical는 C ++로 작성되었습니다.Ghemical 프로젝트 (GNOME 기반으로) 그래픽 사용자 인터페이스를 가지며,이 모두 양자 역학 (반 경험적 AB 론적) 모델 및 분자 역학 모델을 지원한다 (또한 유기 molecu위한 실험 Tripos 5.2 형상 역장...

SyntenyMiner 시각화하고 여러 전체 게놈 서열 간의 비교를 심문 할 수있는 응용 프로그램입니다. 인터페이스는 참조 게놈 시퀀스 일치 탐색보기를 제공합니다. 다른 게놈의 염색체가 추가로 반전, 삽입 / 삭제 및 전좌를 포함하여 크고 작은 규모의 두 게놈 rearragements를 공개, 도트 플롯의 맥락에서 검토 될 수 사이에 순서가...

mpiBLAST는 NCBI의 BLAST의 MPI 기반의 병렬 구현입니다. 이 프로젝트는 formatdb를 교체하고 설치 MPI와 컴퓨터 클러스터에서 병렬로 BLAST 작업을 실행 버전의 blastall 프로그램의 한 쌍으로 구성되어 있습니다. 기존의 BLAST 대 mpiBLAST를 사용하는 두 가지 주요 이점이 있습니다.먼저, mpiBLAST는 클러스터의 각 노드에 걸쳐 데이터베이스를 분할한다. 데이터베이스의 각 노드의 세그먼트이기 때문에 작은 그것은...

RFLP 플래너 RFLP 실험을 계획하는 데 도움이 도구입니다 : 그것은 다른 방법으로 동종 DNA 서열의 세트를 절단하고, 생성 된 겔 전기 영동 이미지를 시뮬레이션 제한 효소를 찾습니다. 프로그램은 인구의 특성을 중요한 제한 효소를 찾는 데 도움이됩니다. 전기 시뮬레이션 또한 겔에서 최고 다형 표시 제한 효소를 선택하기 쉽다.중요한 키워드는 생물 다양성이다.여기에 "RFLP 플래너"의 일부 주요 기능은 다음과...

Adun 프로젝트 데이터 관리 및 분석 기능을 포함하는 확장 가능한 생체 분자 시뮬레이션 프로그램이다.Adun은 직관적 인 사용자 인터페이스뿐만 아니라,보다 유연한 프로그래밍 수준에서 액세스 할 수있는 분자 시뮬레이션을위한 고급 알고리즘 및 프로토콜을 제공합니다. 그것은 생성 및 시뮬레이션을 조작하기위한 강력한 라이브러리입니다 Adun 프레임 워크에 내장되어 있습니다.그러나 그것은을뿐만 아니라 그 능력을 쉽게 확장 할 수 메커니즘을 제공하는 것으로 분석...

GDIS는 디스플레이와 격리 된 분자와주기적인 시스템의 조작을 위해 GTK 기반 프로그램입니다. 이 소프트웨어가 개발되어 있지만, 그럼에도 불구하고 매우 기능적이다.여기에 "GDIS"의 일부 주요 기능은 다음과...

정보학 벤치 마크 시스템은 적절한 테스트 프레임 워크, 테스트, 및 데이터를 구축하는 그 시스템의 성능을 조사하기 위해 최종 사용자와 벤더를 사용하려는 시도가있다.무엇을 우리가하려고하는 것은 테스트를위한 프레임 워크, 모든 다운로드 및 시스템 성능의 특정 요소를 조사하는 데 사용할 수 있습니다 테스트의 핵심 세트를 만드는 것입니다.또한,이 시험에 대한 소스는 GPL에 따라 사용할 수 있으며, 아이디어는 쉽게 측정 및 조정 이유로 의미있는 테스트를...

pyNetConv 일부 네트워크 파일 형식의 변환을 돕기 위해 만든 파이썬 라이브러리입니다.버전 0.6 이후, pyNetConv는 다음과 같은 파일 형식을 읽기 / 쓰기 (과에서 /로 변환) 할 수있다...

NetAtlas 셀룰러 네트워크 신호를 필터링하는 조직의 유전자 발현 데이터를 이용 Cytoscape 플러그인이다. NetAtlas 조직 정의 네트워크, 조직 별 네트워크 구성 요소 및 조직에서 상관 식 구성 요소로 식별합니다.요구 사항...

MacMolPlt는 3 차원 분자 구조 및 정상 모드 (진동)을 플로팅 현대적인 그래픽 프로그램입니다. 현대 수단...