상단 생물 정보학 에 Linux

인간 게놈과 transcriptomes 및 특성 조회, 확장 가능한 결과 데이터베이스 및 관리를위한 사용자 친화적 인 웹 기반 소프트웨어 응용 프로그램과 함께 캡시드 (capsid)는 포괄적 인 오픈 소스 병원균 시퀀스 식별 및 NBSP을위한 고성능 연산 파이프 라인을 통합 플랫폼입니다 결과를 시각화.시작하기당신은 파이썬 2.6+ 설치 및 아파치 톰캣 6 이상을 MongoDB의 데이터베이스가 필요합니다. 자세한 내용은 위키 읽기...

MISO (이성체의 혼합물)의 발현 수준 & NBSP을 quantitates 파이썬으로 작성된 확률 프레임 워크이다 RNA-SEQ 데이터로부터 선택적으로 접합 유전자의 샘플을 통해 차별적 규제 동종 또는 엑손를 식별합니다.RNA-SEQ의 이성체로부터 생성되는 판독함으로써 생성 적 프로세스를 모델링함으로써, MISO 모델 판독이 특정 이성체에 유래하는 확률을 계산하기 위해 베이 즈 추론을 사용한다.MISO 대체 mRNA의 동종의 기본 세트의 풍부함을...

MACS2 칩-SEQ 데이터에 대한 모델 기반 분석 도구입니다.시퀀싱 기술의 개선, 염색질 면역 높은 서열 분석 하였다 (서열 번호 칩)의 전체 게놈 DNA 단백질 상호 작용을 연구하기 위해 점점 인기가있다. 강력한 칩 서열 번호 분석 방법의 부족을 해결하기 위해, 우리는 결합 부위 전사 인자를 식별하기위한 서열 번호 칩 (MACS)의 모델 기반 분석라는 신규 한 알고리즘을 제시한다. MACS 칩은 농후 영역의 중요성을 평가하기 게놈 복잡성의 영향을...

biotools는 파이썬으로 작성된 생물 정보학 유틸리티의 무리입니다 이 요구 사항 : 있습니다. ...

PathVisio는 경로를 그릴 수 system.Can GNU / 리눅스 운영에서 생물학적 경로를 표시하는 분석 및 편집에 사용되는 지상 최대 Java 프로그램 언어로 구현 및 설계 오픈 소스와 완전히 무료 그래픽 응용 프로그램입니다 ,, 생물학적 entitiesThe 소프트웨어는 경로를 그릴 사용자 수 있습니다 링크 생물학적 데이터에 생명체 (단백질 또는 유전자)를 연결, 데이터베이스 식별자, 편집 경로를 사용하여뿐만 아니라 경로를 분석합니다....

Murka 사용자가 쉽게 단순히 중간 네트워크를 사용하여, 계통 문제를 해결하는 데 도움이 무료, 크로스 플랫폼 오픈 소스 명령 줄 소프트웨어입니다. 그것은 경험적 방법, 정확한 알고리즘뿐만 아니라 스타이너 문제 해결사가 포함되어 있습니다.Murka 했음; S 입력은 가역과 정렬 stepmatrix, 출력 즈 (부) 최적 나무 및 이들의 여러 조합을 제공한다. 이 소프트웨어는 리눅스 및 Microsoft Windows 운영 체제 모두에서...

Pathomx (이전 MetaPath)는 시각화 및 GNU / Linux와 다른 POSIX & NBSP에서 대사 데이터의 분석을위한 대화 형 유틸리티 역할을 바닥부터 설계 IPython, Qt를하고 PyQt는 구현 된 오픈 소스 그래픽 소프트웨어입니다 운영 시스템. 그것은 처음 가져 오기 및 NMR 정상화, 비닝 (binning) 및 정렬뿐만 아니라 대사 경로 시각화 및 광산을 포함하여 (핵 자기 공명) 데이터, 스펙트럼 처리, 수출에 대한 지원을 포함...

Jmol은 원래 3D 화학 구조의 분자 뷰어로 작동하도록 설계된 오픈 소스, 크로스 플랫폼 및 무료 그래픽 소프트웨어입니다. HTML5 웹 응용 프로그램, Java 프로그램, Java 애플릿 및 "헤드리스"서버 측 구성 요소와 같은 네 가지 독립 실행 형 모드로 실행됩니다. 요약 한 눈에보기 주요 기능으로는 하이 엔드 하드웨어가 필요없는 고성능 3D 렌더링 지원, JPG, PNG, GIF, PDF, WRL, OBJ 및 POV-Ray 형식으로 파일...

Orthanc는 완전 무료, 오픈 소스, 간단하고 가벼운,하지만 강력한 편안하고 독립 DICOM 의료 및 의학 연구 환경에서 사용할 수 있습니다 (의학의 디지털 이미징 및 통신) 서버입니다. 그것은 했음]. SA 명령 줄 소프트웨어 용이 또한 미니 PACS 시스템으로 알려져 전함 DICOM 저장소에 퍼스널 컴퓨터를 켤 수있는 방식 ++ C로 구현하고 설계 프로그램은 또한 컴퓨터가 어떤 언어에서 구동 될 수 있도록하여 RESTful API (응용...