E-Cell System

E-전지 시스템은 컴퓨터 가상 셀을 구성하는 개념이다.
전자 전지 시스템은 모델링, 시뮬레이션 및 생물학적 세포, 코이치 다카하시에 의해 아키텍처 및 개발자의 한 훌륭한 팀에 의해 작성 등의 대규모 복잡한 시스템의 분석을위한 객체 지향 소프트웨어 제품군입니다. 시스템, 전자 셀 시뮬​​레이션 환경 버전 3의 핵심 부분이 공존하는 다른 시간 척도 여러 알고리즘에 의해 구동 많은 구성 요소를 할 수 있습니다.
E- 셀 프로젝트는 정확한 전체 세포 시뮬레이션을 할 수 있도록 필요한 이론적 지원, 기술 및 소프트웨어 플랫폼 개발을 목표로하는 국제 연구 프로젝트이다.
E-전지 시스템은 다음의 세 가지 주요 부분으로 구성된다 :
- E- 셀 시뮬​​레이션 환경 (또는 E- 셀 SE)
- E- 셀 모델링 환경 (또는 ME를 E는 세포)
- 전자 휴대 분석 툴킷

특징 :

기본 기능 :
객체 지향 모델링과 복잡한 시스템의 시뮬레이션.
플러그인 아키텍처. 새로운 사용자 - 객체 클래스는 동적으로로드 개발 및 시뮬레이션에 사용될 수있다.
시뮬레이션 동안 실시간 사용자 상호 작용 및 시각화.
스크립팅 :
시뮬레이션 세션의 파이썬 스크립팅 (실행 / 정지 / 매개 변수 조작 / 데이터는 ... 등 처리).
시뮬레이션 세션의 많은 실행 포함하는 시뮬레이션 실험의 파이썬 스크립팅 (예 : 매개 변수 조정, 대사 제어 분석 등 등을 ..)
모델 파일 생성의 파이썬 스크립팅 (데이터베이스에서 자동 모델의 건설을위한 예를 들면).
호환성 :
SBML 레벨 1/2 가져 오기.
SBML 레벨 1/2 수출.
병렬 계산 :
공유 메모리, 하나의 시뮬레이션 세션의 멀티 스레드 병렬화. (주요 지점에 병합합니다.)
클러스터 및 그리드는 다수의 시뮬레이션 세션의 계산을 분산. 은 Sun Grid Engine, (글로 버스 툴킷).

이 릴리스의 새로운 기능입니다 :

이 버전은 여러 가지 버그 수정을 추가합니다.

버전 3.1.107 RC2의 새로운 기능 :

이 ecell.Session.saveLoggerData에서 버그를 수정 (). (모리 요시)
ecell.ECDDataFile에서 버그가 수정되었습니다. (모리 요시)

버전 3.1.107 RC1의 새로운 기능 :

고정 컴파일 새로운 GCC에 문제 (한다 = 4.3). (모리 요시)
pyecell에 통합 pyecs. (모리 요시)
ecell.ecs에 병합 ecell.emc은 (맥 OS X 포함) 일부 플랫폼에서 정적 초기화 불확실성을 방지 할 수 있습니다. (모리 요시)
두 GUI 프론트 엔드 (세션 모니터 모델 편집기) 파이썬 모듈, ecell.ui.osogo 및 ecell.ui.model_editor의 두 가지 패키지로 리뉴얼했다. (모리 요시)
ecell / 프론트 엔드 / session_manager에있는 ecell.ui.osogo.GtkSessionMonitor로 이동 GtkSessionMonitor. (모리 요시)
이름이 바뀐 ecell.SessionManager는 ecell.session_manager합니다. (모리 요시)
ecell.ecs_constants에서 다음 상수를 제거. (모리 요시)