가장 좋은 생물 정보학 에 Linux

Adun 프로젝트 데이터 관리 및 분석 기능을 포함하는 확장 가능한 생체 분자 시뮬레이션 프로그램이다.Adun은 직관적 인 사용자 인터페이스뿐만 아니라,보다 유연한 프로그래밍 수준에서 액세스 할 수있는 분자 시뮬레이션을위한 고급 알고리즘 및 프로토콜을 제공합니다. 그것은 생성 및 시뮬레이션을 조작하기위한 강력한 라이브러리입니다 Adun 프레임 워크에 내장되어 있습니다.그러나 그것은을뿐만 아니라 그 능력을 쉽게 확장 할 수 메커니즘을 제공하는 것으로 분석...

MacMolPlt는 3 차원 분자 구조 및 정상 모드 (진동)을 플로팅 현대적인 그래픽 프로그램입니다. 현대 수단...

massXpert 질량 분석 패키지는 선형 (생물) 중합체의 질량 분석 환경이다. 이 크로스 플랫폼 개발 환경에 해당 프로젝트의 포트로는, GNU의 polyxmass의 모든 혁신을 상속 이 릴리스의 새로운 기능 :. XpertMiner에서 개선 쉽게 목록을 작업 할 모듈;저해상도 큰 중합체의 동위 원소 클러스터를 계산할 때 등장 고정 계산 버그 ... 피크 형상은 평균 중심 값을 중심으로되지 않을 것이다.하나는 주어진 중합체의 분해에 의해 얻어진...

는 버로우즈 - 휠러 얼 라이너 (BWA)는 예컨대 인간 게놈으로 긴 레퍼런스 시퀀스에 대해 상대적으로 짧은 뉴클레오티드 서열 정렬 효율적인 프로그램이다.이 소프트웨어는 두 알고리즘, BWA-짧고 BWA-SW를 구현합니다. 쿼리에 대한 이전의 작품은 200bp보다 짧은 주위 100kbp까지 긴 시퀀스에 대한 후자의 시퀀스.두 알고리즘 모두는 갭 첨부 정렬을한다. 그들은 일반적으로보다 정확하고 빠른 낮은 오류율 쿼리에 있습니다. 자세한 내용은 BWA...

흘러도 바이너리 데이터 파일을 읽기위한 파이썬 API가 망둥이 차세대 데이터 관리 프레임 워크를 사용하여 만든 것입니다.일반적으로,이 디렉토리의 완전한 무지 패키지의 일부로 사용할 수 온다 :& NBSP; HTTP : //goby.campagnelab.org/전체 패키지는 Java 소스 코드가 포함되어 있습니다. 당신이 PyPI 또는 다른 파이썬 고유의 소스에서이 패키지를 다운로드 한 경우, 당신은 코드 만 파이썬 부분을 받았습니다 수 있습니다.개발...

MACS2 칩-SEQ 데이터에 대한 모델 기반 분석 도구입니다.시퀀싱 기술의 개선, 염색질 면역 높은 서열 분석 하였다 (서열 번호 칩)의 전체 게놈 DNA 단백질 상호 작용을 연구하기 위해 점점 인기가있다. 강력한 칩 서열 번호 분석 방법의 부족을 해결하기 위해, 우리는 결합 부위 전사 인자를 식별하기위한 서열 번호 칩 (MACS)의 모델 기반 분석라는 신규 한 알고리즘을 제시한다. MACS 칩은 농후 영역의 중요성을 평가하기 게놈 복잡성의 영향을...

PySCeS는 분자 세포 생리학 & NBSP의 트리플 J 그룹에 의해 개발 된 프로젝트입니다 모델을 시도하고 살아있는 세포를 구성하는 복잡한 프로세스와 시스템을 이해하기 위해 이 특징 :. 텍스트 기반 모델 기술 언어.구조 해석 모듈.시간 시뮬레이션을위한 통합정상 상태 분석을위한 비선형 솔버신진 대사 작용 분석을 수행하는 모듈여러 정상 상태를 나타내는 시스템 분기 모듈매개 변수 검사, 데이터 출력 및 플로팅에 대한 추가 해주는 유틸리티의...

STEME 프로젝트는 MEME 등의 주제 측정기에 사용되는 모델의 유형에 대한 기대 - 극대화, 알고리즘에 근사치로 생활을 시작했다.STEME 및 다른 URL;의 EM 근사 배 정도 더 빨리보다 일반적인 매개 변수 설정에 대한 MEME 구현을 실행합니다. STEME는 이제 그 자체로 제몫을 모티브 찾기로 발전하고있다.왜 STEME를 사용합니까?검증 된 모티브 발견 기술STEME은 시험하려고 앤 MEME 알고리즘에 기초한다. MEME는 가장 성숙하고...

SyntenyMiner 시각화하고 여러 전체 게놈 서열 간의 비교를 심문 할 수있는 응용 프로그램입니다. 인터페이스는 참조 게놈 시퀀스 일치 탐색보기를 제공합니다. 다른 게놈의 염색체가 추가로 반전, 삽입 / 삭제 및 전좌를 포함하여 크고 작은 규모의 두 게놈 rearragements를 공개, 도트 플롯의 맥락에서 검토 될 수 사이에 순서가...

NetAtlas 셀룰러 네트워크 신호를 필터링하는 조직의 유전자 발현 데이터를 이용 Cytoscape 플러그인이다. NetAtlas 조직 정의 네트워크, 조직 별 네트워크 구성 요소 및 조직에서 상관 식 구성 요소로 식별합니다.요구 사항...