가장 좋은 생물 정보학 에 Linux

VULCAN 프로젝트는 전산 유체 역학 분석을 제공합니다.VULCAN (복잡한 흐름 분석을위한 점성 맞바람 알고리즘은) 극 초음속 난류 반응과 직렬 및 병렬 컴퓨팅 플랫폼의 다양한 흐름을 비 반응을 통해 아음속 속도에 대한 전산 유체 역학을 제공합니다.추진 유동 해석의 계산량은 타원과 공간 마칭 스킴 특수 난류 벽먼트, 멀티 그리드 방법의 사용을 통해 감소되고, 조절의 지배 방정식은 수치 강성을 감소.물리적 모델링 기능은 압축성, 레이놀즈 응력 이방성,...

Murka 사용자가 쉽게 단순히 중간 네트워크를 사용하여, 계통 문제를 해결하는 데 도움이 무료, 크로스 플랫폼 오픈 소스 명령 줄 소프트웨어입니다. 그것은 경험적 방법, 정확한 알고리즘뿐만 아니라 스타이너 문제 해결사가 포함되어 있습니다.Murka 했음; S 입력은 가역과 정렬 stepmatrix, 출력 즈 (부) 최적 나무 및 이들의 여러 조합을 제공한다. 이 소프트웨어는 리눅스 및 Microsoft Windows 운영 체제 모두에서...

STEPS는 임의의 복잡한 3D 형상의 반응 - 확산 시스템의 정확한 확률 적 시뮬레이션을위한 패키지입니다. 우리의 핵심 시뮬레이션 알고리즘은 길레스피의 SSA의 구현, 3D 사면체 메쉬의 요소를 분자의 확산에 대처하기 위해 확장.그것은 주로 수상 돌기 및 시냅스 주변 신경 신호 전달 경로의 상세한 모델을 시뮬레이션하기 위해 개발되었지만, 그것은 일반적인 도구와 공간적 기울기 및 형태가 역할을하는 것으로 생각되는 임의의 생화학 적 경로를 연구에 사용될...

인간 게놈과 transcriptomes 및 특성 조회, 확장 가능한 결과 데이터베이스 및 관리를위한 사용자 친화적 인 웹 기반 소프트웨어 응용 프로그램과 함께 캡시드 (capsid)는 포괄적 인 오픈 소스 병원균 시퀀스 식별 및 NBSP을위한 고성능 연산 파이프 라인을 통합 플랫폼입니다 결과를 시각화.시작하기당신은 파이썬 2.6+ 설치 및 아파치 톰캣 6 이상을 MongoDB의 데이터베이스가 필요합니다. 자세한 내용은 위키 읽기...

AREM는 (칩 서열 데이터에 대한 모델 기반 분석) 맥을 기반으로합니다.염색질 면역 침전 (칩 서열)에 결합 높은 처리량 시퀀싱 널리 게놈 전반 전사 인자, 보조 인자, 염색질 개질제 및 다른 DNA 결합 단백질의 결합 패턴을 특징으로 사용된다. 칩 서열 데이터 분석의 주요 단계는 참조 게놈 단편 높은 처리량 시퀀싱로부터 판독 매핑 짧은 읽기 풍부 피크 영역을 식별하는 것이다.몇 가지 방법이 칩 - 서열 분석을 위해 제안되었지만, 대부분의 기존 사내...

Syntainia 여러 게놈의 시각화를위한 혁신적인 응용 프로그램입니다합니다. & nbsp; 그것은 유전자의 그룹 사이의 관계를보고 조작 할 수있는 간단하고 직관적 인 사용자 인터페이스를 제공합니다. 명확한 유전자 시각화, 그것은 여러 게놈 사이 synteny의 보존을 식별 할 수있는 연구자를위한 쉽다.  Syntainia 훌륭한 외모와 윈도우, 리눅스 및 Mac OS X에서 원활하게 실행하고 또한 자바 6와 다른 운영 체제에서 작동하는 데스크톱 응용...

Orthanc는 완전 무료, 오픈 소스, 간단하고 가벼운,하지만 강력한 편안하고 독립 DICOM 의료 및 의학 연구 환경에서 사용할 수 있습니다 (의학의 디지털 이미징 및 통신) 서버입니다. 그것은 했음]. SA 명령 줄 소프트웨어 용이 또한 미니 PACS 시스템으로 알려져 전함 DICOM 저장소에 퍼스널 컴퓨터를 켤 수있는 방식 ++ C로 구현하고 설계 프로그램은 또한 컴퓨터가 어떤 언어에서 구동 될 수 있도록하여 RESTful API (응용...

이탄, 캡처 예측하고 단백질의 생물 물리학 적 특성을 분석하는 일련의 프로그램이다.문서, 지침, 스크린 샷 등을 위해 http://enzyme.ucd.ie/PEAT를 참조하십시오 이 요구 사항 : 있습니다. ...

LSim는 거대 분자의 전자 밀도를 중첩과 구조적 유사성 점수를 계산한다. 그 계산은 분자의 크기가 비교되는 선형 적으로 확장.LSim 정렬은 생화학 적 구조 요소 개념적으로 관련이없는, 따라서, 구조 전용 단백질 유사성 연구에 대한 편견과 적합하다.설치 :배포 파일의 압축을 풉니 다 :타르 -xzvf lsim-linux.tar.gz파일 디렉토리로 이동 :CD의 lsim.1.0.0복사, 이동 또는 적절한 위치에 실행 파일 lsim 연결 - 그리고 확인...

. TRMiner 파이썬 과학적 데이터 큐레이터 목표로 유틸리티 & NBSP이다 그것은 급속하게 주어진 광산 목표에 대한 관련 문장에 과학 출판물의 큰 컬렉션을 치기 할 수 있습니다.이것은 두 단계로 이루어진다. 첫째, 텍스트 관련 단어 토큰의 시퀀스로 tranlated된다. 둘째, 정규 표현식 패턴은 토큰의 순서로 검색됩니다. 일치는 자연 언어 문장으로 다시 번역 및 수동 큐레이터가 정렬하고 그 외의 읽을 거리 및 정보 추출을위한 속도 일치 할 수...