STEPS

STEPS는 임의의 복잡한 3D 형상의 반응 - 확산 시스템의 정확한 확률 적 시뮬레이션을위한 패키지입니다. 우리의 핵심 시뮬레이션 알고리즘은 길레스피의 SSA의 구현, 3D 사면체 메쉬의 요소를 분자의 확산에 대처하기 위해 확장.
그것은 주로 수상 돌기 및 시냅스 주변 신경 신호 전달 경로의 상세한 모델을 시뮬레이션하기 위해 개발되었지만, 그것은 일반적인 도구와 공간적 기울기 및 형태가 역할을하는 것으로 생각되는 임의의 생화학 적 경로를 연구에 사용될 수있다.
우리는 STEPS 사용자 모델을 설정하는 메시를 발생 시뮬레이션 및 생성을 제어하고 출력을 분석의 모든 측면을 제어하도록 Python 스크립트를 사용할 수 있다는 것을 의미 파이썬 모듈 세트,하기의 순서대로 실시 하였다. 핵심 계산 루틴은 여전히​​ 실행의 최대 속도에 대한 C / C ++ 확장 모듈로 구현됩니다.
단계는 GPL v3의 라이센스하에 배포됩니다

이 요구 사항 : 있습니다.

파이썬