Pathomx

Pathomx (이전 MetaPath)는 시각화 및 GNU / Linux와 다른 POSIX & NBSP에서 대사 데이터의 분석을위한 대화 형 유틸리티 역할을 바닥부터 설계 IPython, Qt를하고 PyQt는 구현 된 오픈 소스 그래픽 소프트웨어입니다 운영 시스템. 그것은 처음 가져 오기 및 NMR 정상화, 비닝 (binning) 및 정렬뿐만 아니라 대사 경로 시각화 및 광산을 포함하여 (핵 자기 공명) 데이터, 스펙트럼 처리, 수출에 대한 지원을 포함 glanceKey 기능에 대사 체학 data.Features 처리를 위해 사용될 수 있도록 설계되었다. 또한 지정된 경로에 시각화를 위해 다양한 경로를 통해 유전자 및 대사 체학 데이터를 가져올 수있을 것입니다.
다양한 MetaCyc 데이터베이스 주석은 또한 우리가 데이터베이스 통일 링크, 동의어뿐만 아니라 관련된 경로와 반응을 언급 할 수있는 중 Pathomx 응용 프로그램에 포함되어 있습니다. MetaCyc 데이터베이스가 공개 API에서 파생된다는 점에 유의하시기 바랍니다.
이 응용 프로그램은 빠른 복잡한 데이터 세트의 탐사, 확장하는 감사와 구성 플러그인에 대한 강력한 MetaCyc 데이터베이스를 사용합니다. 또한, matplotlib에서이 그래프에 대한 NMR 데이터 가져 오기 nmrglue가, 대화 형 그래프에 대한 d3.js, 처리 수의 NumPy와 및 Scipy 라이브러리를 사용하고, 통계 분석 methods.Under 후드에 대한 scikit는 배우기와의 후드 OSesLooking 지원 Pathomx, 우리는 응용 프로그램이 IPython 명령 쉘에 내장 된 것을 알 수 있습니다. 그것은 또한 사전 구축 된 바이너리 패키지로 다운로드 할 수 있습니다에서는 Microsoft Windows와 Mac OS X 운영 체제에서 잘 작동합니다. GNU / Linux의 경우, 소프트웨어는 32 비트 및 64 비트 하드웨어 플랫폼과 호환 gzip으로 압축 된 소스 아카이브로 배포됩니다.
Pathomx를 사용하는 경우, 사용자는 응용 프로그램이 BioCyc 제품군의 일부입니다 MetaCyc 경로 데이터베이스 자체에서 데이터를 사용합니다 있음을 알아 두셔야합니다. MetaCyc API는 로컬로 저장됩니다 제공된 데이터베이스를 생성하는 데 사용됩니다

이 릴리스의 새로운 기능입니다.

이 완전히 새로운 드래그 앤 드롭 비주얼 에디터가 추가되었습니다.
그것은 당신이 작업 공간으로 도구를 드래그 도구 사이의 데이터 라인을 드래그하여 연결을 편집하고, 현재 처리의 개요를 인라인 뷰를 사용하여 분석 워크 플로우를 만들 수 있습니다.
데이터는 즉시 가져 오기를 위해 작업 공간으로 삭제할 수 있습니다.
또한 당 도구 알림 바, 상태 표시기를 진행 라이브 덧붙였다.
오류가 도움을 텍스트로 플래그가 (도구에 대한 툴팁은 빨간색 표시 할 때).

이 요구 사항 :

이 graphviz를