CaPSID

인간 게놈과 transcriptomes 및 특성 조회, 확장 가능한 결과 데이터베이스 및 관리를위한 사용자 친화적 인 웹 기반 소프트웨어 응용 프로그램과 함께

캡시드 (capsid)는 포괄적 인 오픈 소스 병원균 시퀀스 식별 및 NBSP을위한 고성능 연산 파이프 라인을 통합 플랫폼입니다 결과를 시각화.
시작하기
당신은 파이썬 2.6+ 설치 및 아파치 톰캣 6 이상을 MongoDB의 데이터베이스가 필요합니다. 자세한 내용은 위키 읽기 :
http://wiki.github.com/capsid/capsid/home

What이 릴리스의 새로운 기능입니다 :

이 수정 오류 메시지를 빼기 및 정렬을 실행할 때 찾을 수 없습니다
오래 실행되는 쿼리를 고정에 대한 추가 작업

이 어떤 버전 1.4.2의 새로운 기능 :

는 MongoKit 의존성을 제거합니다

이 버전 1.4.1의 새로운 기능 : 장기 실행 통계 쿼리에 대한

이 수정 커서 시간 제한

이 버전 1.4.0의 새로운 기능 : 그들은 마지막에 모든보다는 실행되는 동안

이 통계를 추가
UID와 같은 유전자에 대해 고유 한 ID를 저장

이 버전 1.2.7의 새로운 기능 :

이 수정 README

이 버전 1.2.6의 새로운 기능 :

이 뺄셈 매핑 구축 할 때 매핑되지 않은 읽기 필터링

이 버전 1.2의 새로운 기능 :

FastQ 파일을 생성하는 유틸리티 매핑되지 않은 읽기에서
유틸리티 FastQ 파일의 교차로를 반환
유틸리티 필터 FastQ 파일을 반환
뺄셈에 추가 mapq 임계 값 플래그
Gbloader 지금 박테리아와 곰팡이의 게놈을로드 할 수 있습니다
데이터베이스 사용 GridFS에 게놈 시퀀스를 저장
감소 메모리 사용량 통계를 계산
사용 서브 프로세스 대신 os.system을의
mapq 점수 필터는 0을 포함해야

이 버전 1.1의 새로운 기능 :

이 쌍 엔드에 대한 지원을 읽 추가

이 버전 1.0.1의 새로운 기능 :

이 MongoDB의 인증에 대한 지원이 추가되었습니다에게

이 요구 사항 :

이 파이썬