가장 좋은 생물 정보학 에 Linux

picme 프로그램이 추정하고 큰 데이터 세트에 대한 계통 정보 성 음모가 포함 된 파이썬 패키지입니다.설치순간, 프로그램을 설치하는 가장 쉬운 방법은 다음과 같습니다자식 복제 자식 : //github.com/faircloth-lab/picme.git / 경로 /에 / picme테스트를 실행하려면 :CD / 경로 /에 / picme /파이썬 테스트 / test_townsend_code.py용도estimate_p_i.py 코드 템플릿 /에의 HyPHY에...

Pathomx (이전 MetaPath)는 시각화 및 GNU / Linux와 다른 POSIX & NBSP에서 대사 데이터의 분석을위한 대화 형 유틸리티 역할을 바닥부터 설계 IPython, Qt를하고 PyQt는 구현 된 오픈 소스 그래픽 소프트웨어입니다 운영 시스템. 그것은 처음 가져 오기 및 NMR 정상화, 비닝 (binning) 및 정렬뿐만 아니라 대사 경로 시각화 및 광산을 포함하여 (핵 자기 공명) 데이터, 스펙트럼 처리, 수출에 대한 지원을 포함...

Ghemical는 GNU GPL 아래 계산 화학 소프트웨어 패키지입니다. 이 패키지의 전체 소스 코드를 사용할 수 있으며, 사용자가 공부하고 패키지를 자유롭게 변경할 수 있음을 의미한다. Ghemical는 C ++로 작성되었습니다.Ghemical 프로젝트 (GNOME 기반으로) 그래픽 사용자 인터페이스를 가지며,이 모두 양자 역학 (반 경험적 AB 론적) 모델 및 분자 역학 모델을 지원한다 (또한 유기 molecu위한 실험 Tripos 5.2 형상 역장...

LSim는 거대 분자의 전자 밀도를 중첩과 구조적 유사성 점수를 계산한다. 그 계산은 분자의 크기가 비교되는 선형 적으로 확장.LSim 정렬은 생화학 적 구조 요소 개념적으로 관련이없는, 따라서, 구조 전용 단백질 유사성 연구에 대한 편견과 적합하다.설치 :배포 파일의 압축을 풉니 다 :타르 -xzvf lsim-linux.tar.gz파일 디렉토리로 이동 :CD의 lsim.1.0.0복사, 이동 또는 적절한 위치에 실행 파일 lsim 연결 - 그리고 확인...

ProteinShop 단백질 구조를 조작하기위한 대화 형 도구입니다. 그것은 신속 인간의 지식과 직관을 사용 단백질 구성의 세트를 생성하도록 설계되었다. 이러한 구성은 로컬 또는 글로벌 최적화를 실시 할 수있다. ProteinShop 비록글로벌 최적화 프로세스 자체를 실시하지 않고, 그것을 제공글로벌 최적화 프로세스와 상호 작용하는데 사용될 수있다 워크즉, 원격 컴퓨터에서 실행 할 수있다.ProteinShop는 기능의 세 가지 수준을 제시레벨 내가 :...

Syntainia 여러 게놈의 시각화를위한 혁신적인 응용 프로그램입니다합니다. & nbsp; 그것은 유전자의 그룹 사이의 관계를보고 조작 할 수있는 간단하고 직관적 인 사용자 인터페이스를 제공합니다. 명확한 유전자 시각화, 그것은 여러 게놈 사이 synteny의 보존을 식별 할 수있는 연구자를위한 쉽다.  Syntainia 훌륭한 외모와 윈도우, 리눅스 및 Mac OS X에서 원활하게 실행하고 또한 자바 6와 다른 운영 체제에서 작동하는 데스크톱 응용...

이탄, 캡처 예측하고 단백질의 생물 물리학 적 특성을 분석하는 일련의 프로그램이다.문서, 지침, 스크린 샷 등을 위해 http://enzyme.ucd.ie/PEAT를 참조하십시오 이 요구 사항 : 있습니다. ...

edittag은 플랫폼 별 시퀀싱 어댑터와 PCR 프라이머로 서열 태그를 편집 메트릭 시퀀스 태그 세트를 디자인 편집 메트릭 형태에 대한 일련의 태그를 확인하고, 통합에 대한 응용 프로그램 모음입니다. edittag는 다른 접근 방식과 다릅니다& NBSP; * edittag 멀티 프로세싱을 사용하여 적절한 시간 프레임 편집 - 메트릭 시퀀스 태그의 임의의 길이를 생성& NBSP; * edittag 편집 메트릭 시퀀스 태그 세트를 선택한 편집 거리를 준수...

reciprocal_smallest_distance 글로벌 서열 정렬과 시퀀스 사이의 최대 우도 진화 거리를 정확하게 게놈 사이의 orthologs를 감지 할 수를 사용하는 페어 orthology 알고리즘입니다.타르볼에서 설치다운로드 GitHub의에서 최신 버전의 압축을 풉니 다CD ~컬 -L...

메이크업 등의 시스템을 구축 자주 예를 들어 복잡한 워크 플로우를 생성하는 데 사용됩니다 . 생물 정보학 & NBSP에, snakemake 함께 빠르고 편안하게 실행 환경, 파이썬 스타일의 깨끗하고 현대적인 도메인 특정 사양 언어 (DSL)를 제공하여 워크 플로를 만들 수의 복잡성을 감소시키기 위하여 제정되었습니다.설치- 우분투 12.04에, 당신은 우리의 런치 패드 저장소에 사용할 수있는 데비안 패키지 python3-snakemake를 설치할 수...