이 있어야 함 생물 정보학 에 Linux

흘러도 바이너리 데이터 파일을 읽기위한 파이썬 API가 망둥이 차세대 데이터 관리 프레임 워크를 사용하여 만든 것입니다.일반적으로,이 디렉토리의 완전한 무지 패키지의 일부로 사용할 수 온다 :& NBSP; HTTP : //goby.campagnelab.org/전체 패키지는 Java 소스 코드가 포함되어 있습니다. 당신이 PyPI 또는 다른 파이썬 고유의 소스에서이 패키지를 다운로드 한 경우, 당신은 코드 만 파이썬 부분을 받았습니다 수 있습니다.개발...

HTSeq 처리하고 높은 처리량 시퀀싱 데이터 (HTS) 분석을 분석하는 파이썬 프레임 워크입니다 이 요구 사항 : 있습니다. ...

Jmol은 원래 3D 화학 구조의 분자 뷰어로 작동하도록 설계된 오픈 소스, 크로스 플랫폼 및 무료 그래픽 소프트웨어입니다. HTML5 웹 응용 프로그램, Java 프로그램, Java 애플릿 및 "헤드리스"서버 측 구성 요소와 같은 네 가지 독립 실행 형 모드로 실행됩니다. 요약 한 눈에보기 주요 기능으로는 하이 엔드 하드웨어가 필요없는 고성능 3D 렌더링 지원, JPG, PNG, GIF, PDF, WRL, OBJ 및 POV-Ray 형식으로 파일...

LSim는 거대 분자의 전자 밀도를 중첩과 구조적 유사성 점수를 계산한다. 그 계산은 분자의 크기가 비교되는 선형 적으로 확장.LSim 정렬은 생화학 적 구조 요소 개념적으로 관련이없는, 따라서, 구조 전용 단백질 유사성 연구에 대한 편견과 적합하다.설치 :배포 파일의 압축을 풉니 다 :타르 -xzvf lsim-linux.tar.gz파일 디렉토리로 이동 :CD의 lsim.1.0.0복사, 이동 또는 적절한 위치에 실행 파일 lsim 연결 - 그리고 확인...

MacMolPlt는 3 차원 분자 구조 및 정상 모드 (진동)을 플로팅 현대적인 그래픽 프로그램입니다. 현대 수단...

MACS2 칩-SEQ 데이터에 대한 모델 기반 분석 도구입니다.시퀀싱 기술의 개선, 염색질 면역 높은 서열 분석 하였다 (서열 번호 칩)의 전체 게놈 DNA 단백질 상호 작용을 연구하기 위해 점점 인기가있다. 강력한 칩 서열 번호 분석 방법의 부족을 해결하기 위해, 우리는 결합 부위 전사 인자를 식별하기위한 서열 번호 칩 (MACS)의 모델 기반 분석라는 신규 한 알고리즘을 제시한다. MACS 칩은 농후 영역의 중요성을 평가하기 게놈 복잡성의 영향을...

massXpert 질량 분석 패키지는 선형 (생물) 중합체의 질량 분석 환경이다. 이 크로스 플랫폼 개발 환경에 해당 프로젝트의 포트로는, GNU의 polyxmass의 모든 혁신을 상속 이 릴리스의 새로운 기능 :. XpertMiner에서 개선 쉽게 목록을 작업 할 모듈;저해상도 큰 중합체의 동위 원소 클러스터를 계산할 때 등장 고정 계산 버그 ... 피크 형상은 평균 중심 값을 중심으로되지 않을 것이다.하나는 주어진 중합체의 분해에 의해 얻어진...

. MongoDB를 데이터베이스 위에 추상화 계층으로 MetagenomeDB 행위 MetagenomeDB 쉽게를 & nbsp, 저장, 검색 및 metagenomic 시퀀스를 주석하기위한 파이썬 라이브러리입니다. 그것은 개체, 즉 시퀀스와 컬렉션의 두 가지 유형을 만들고 수정하고 연결하는 API를 제공합니다 :& NBSP; * 시퀀스 (순서 클래스)가 될 수 읽기, 콘티, PCR 클론 등& NBSP * (컬렉션 클래스) 시퀀스들의 세트를 나타내는 수집;...

MISO (이성체의 혼합물)의 발현 수준 & NBSP을 quantitates 파이썬으로 작성된 확률 프레임 워크이다 RNA-SEQ 데이터로부터 선택적으로 접합 유전자의 샘플을 통해 차별적 규제 동종 또는 엑손를 식별합니다.RNA-SEQ의 이성체로부터 생성되는 판독함으로써 생성 적 프로세스를 모델링함으로써, MISO 모델 판독이 특정 이성체에 유래하는 확률을 계산하기 위해 베이 즈 추론을 사용한다.MISO 대체 mRNA의 동종의 기본 세트의 풍부함을...

mpiBLAST는 NCBI의 BLAST의 MPI 기반의 병렬 구현입니다. 이 프로젝트는 formatdb를 교체하고 설치 MPI와 컴퓨터 클러스터에서 병렬로 BLAST 작업을 실행 버전의 blastall 프로그램의 한 쌍으로 구성되어 있습니다. 기존의 BLAST 대 mpiBLAST를 사용하는 두 가지 주요 이점이 있습니다.먼저, mpiBLAST는 클러스터의 각 노드에 걸쳐 데이터베이스를 분할한다. 데이터베이스의 각 노드의 세그먼트이기 때문에 작은 그것은...