무료 생물 정보학 에 Linux

STEPS는 임의의 복잡한 3D 형상의 반응 - 확산 시스템의 정확한 확률 적 시뮬레이션을위한 패키지입니다. 우리의 핵심 시뮬레이션 알고리즘은 길레스피의 SSA의 구현, 3D 사면체 메쉬의 요소를 분자의 확산에 대처하기 위해 확장.그것은 주로 수상 돌기 및 시냅스 주변 신경 신호 전달 경로의 상세한 모델을 시뮬레이션하기 위해 개발되었지만, 그것은 일반적인 도구와 공간적 기울기 및 형태가 역할을하는 것으로 생각되는 임의의 생화학 적 경로를 연구에 사용될...

맥은 프로그램 평가 및 대형 데이터 세트에 대한 계통 정보 성 음모가 포함 된 파이썬 도구입니다.인용 맥맥을 사용하는 경우, 인용하십시오- Faircloth BC, 장 J, 알파 ME : 맥은 계통 발생 학적 정보 성 높은 처리량 분석을 할 수 있습니다.- 타운센드 JP : 계통 정보 성 프로파일 링. 체계적인 BIOL. 2007, 56 : 222-231.- 연못 SLK, 프로스트 SDW, 뮤즈 SV :의 HyPHY : 사용하여 계통을 테스트 가설....

picme 프로그램이 추정하고 큰 데이터 세트에 대한 계통 정보 성 음모가 포함 된 파이썬 패키지입니다.설치순간, 프로그램을 설치하는 가장 쉬운 방법은 다음과 같습니다자식 복제 자식 : //github.com/faircloth-lab/picme.git / 경로 /에 / picme테스트를 실행하려면 :CD / 경로 /에 / picme /파이썬 테스트 / test_townsend_code.py용도estimate_p_i.py 코드 템플릿 /에의 HyPHY에...

tigreBrowser는 티 그레 R 패키지의 결과에 대한 유전자 발현 모델 브라우저입니다 (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html).설치 :tigreBrowser 파이썬 버전> = 2.5가 필요합니다. tigreBrowser는 다음 명령으로 설치할 수 있습니다 :파이썬 설치 setup.py(예를 들어, 현재 사용자에 대한 루트 권한없이 설치) 파이썬 모듈을 설치하는 방법에...

checkmyclones이 생거 시퀀싱 결과를 & nbsp 확인하는 도구를 제공하는 소프트웨어입니다. (좌표 포함) 적절한 형식으로 제공 (또는 일반 텍스트 또는 FASTQ 파일) 참조 시퀀스의 집합에 대해, 요구 사항 : ...

Syntainia 여러 게놈의 시각화를위한 혁신적인 응용 프로그램입니다합니다. & nbsp; 그것은 유전자의 그룹 사이의 관계를보고 조작 할 수있는 간단하고 직관적 인 사용자 인터페이스를 제공합니다. 명확한 유전자 시각화, 그것은 여러 게놈 사이 synteny의 보존을 식별 할 수있는 연구자를위한 쉽다.  Syntainia 훌륭한 외모와 윈도우, 리눅스 및 Mac OS X에서 원활하게 실행하고 또한 자바 6와 다른 운영 체제에서 작동하는 데스크톱 응용...

. CWC 시뮬레이터는 C ++ CWC, 표현 및 생물 시스템의 시뮬레이션 & NBSP에 대한 수학의 구현이며, 성공적인 설치 (INSTALL) 후에는 몇 가지 예에서와 같이, CWC 모델을 통해 시뮬레이션을 실행 할 수 있습니다 (/ 예 참조).(명령 줄) 인터페이스일반 사용자로서, 당신은 실행해야합니다 :-i model.cwc-o -t -s -n -c --qt 임계 -q -w 장소 :- 는 실행 파일의 이름 (기본값 : scwc);& NBSP -...

AREM는 (칩 서열 데이터에 대한 모델 기반 분석) 맥을 기반으로합니다.염색질 면역 침전 (칩 서열)에 결합 높은 처리량 시퀀싱 널리 게놈 전반 전사 인자, 보조 인자, 염색질 개질제 및 다른 DNA 결합 단백질의 결합 패턴을 특징으로 사용된다. 칩 서열 데이터 분석의 주요 단계는 참조 게놈 단편 높은 처리량 시퀀싱로부터 판독 매핑 짧은 읽기 풍부 피크 영역을 식별하는 것이다.몇 가지 방법이 칩 - 서열 분석을 위해 제안되었지만, 대부분의 기존 사내...

AHREA 상대 표현을 찾는 것은 쉬운 학습하게 소프트웨어 적 제품군입니다. 그것은 파이썬으로 작성되어 요구 사항 : 있습니다. ...

E-전지 시스템은 컴퓨터 가상 셀을 구성하는 개념이다.전자 전지 시스템은 모델링, 시뮬레이션 및 생물학적 세포, 코이치 다카하시에 의해 아키텍처 및 개발자의 한 훌륭한 팀에 의해 작성 등의 대규모 복잡한 시스템의 분석을위한 객체 지향 소프트웨어 제품군입니다. 시스템, 전자 셀 시뮬​​레이션 환경 버전 3의 핵심 부분이 공존하는 다른 시간 척도 여러 알고리즘에 의해 구동 많은 구성 요소를 할 수 있습니다.E- 셀 프로젝트는 정확한 전체 세포 시뮬레이션을...