가장 좋은 교육 및 과학 소프트웨어 에 Armin Topfer
InDelFixer 차세대 시퀀싱 데이터로부터 삽입 또는 삭제를 야기 프레임 시프트를 제거하는 자바 프로그램이다. 경우에 따라서는 원하는 단백질이 프레임 시프트와의 변형이없는 것으로 알려져있다. 이 프레임 이동은 주어진 참조 게놈 (또는 이후 버전에서 여러 정렬)으로 보정 할 수있다. 이 프로그램은 FASTQ 파일로 표준 흐름 그램 형식의 파일, FASTA / PacBio의 CCS 파일 및 일루미나 쌍 엔드 데이터를 받아 이 요구 사항 : 있습니다. ...
QuasiRecomb Quasispecies 바이러스를 생성 마르코프 모델을 시뮬레이션 명령 콘솔에서 실행 경량 애플리케이션이다. 이는 차세대 시퀀싱 데이터를 분석하여 그 파라미터를 추론하는 바이러스 quasispecies 및 방법의 발전을 설명한다. 이 모델은 명시 적으로 고려 재조합 과정을 복용의 장점을 보여주는 시뮬레이션 데이터 검증 및 실험 HIV 샘플에서 얻은 읽기에 적용하여 시험한다. 그것은 quasispecies에 바이러스 균주의 분포를...
