새로운 교육 및 과학 소프트웨어 에 Armin Topfer
QuasiRecomb Quasispecies 바이러스를 생성 마르코프 모델을 시뮬레이션 명령 콘솔에서 실행 경량 애플리케이션이다. 이는 차세대 시퀀싱 데이터를 분석하여 그 파라미터를 추론하는 바이러스 quasispecies 및 방법의 발전을 설명한다. 이 모델은 명시 적으로 고려 재조합 과정을 복용의 장점을 보여주는 시뮬레이션 데이터 검증 및 실험 HIV 샘플에서 얻은 읽기에 적용하여 시험한다. 그것은 quasispecies에 바이러스 균주의 분포를...
InDelFixer 차세대 시퀀싱 데이터로부터 삽입 또는 삭제를 야기 프레임 시프트를 제거하는 자바 프로그램이다. 경우에 따라서는 원하는 단백질이 프레임 시프트와의 변형이없는 것으로 알려져있다. 이 프레임 이동은 주어진 참조 게놈 (또는 이후 버전에서 여러 정렬)으로 보정 할 수있다. 이 프로그램은 FASTQ 파일로 표준 흐름 그램 형식의 파일, FASTA / PacBio의 CCS 파일 및 일루미나 쌍 엔드 데이터를 받아 이 요구 사항 : 있습니다. ...
