새로운 생물 정보학 에 Linux

인감 하둡에 서열 정렬을 제공하는 파이썬 모듈이다.인감 생물학적 서열 정렬을위한 맵리 듀스의 응용 프로그램입니다. 그것은 Pydoop을 통해 하둡 (http://hadoop.apache.org) (http://pydoop.sourceforge.net), 하둡을위한 파이썬 맵리 듀스와 HDFS API에서 실행 이 요구 사항 :. ...

avalanchetoolbox 식별하고 같은 신경 눈사태로 분기 프로세스를 설명하기위한 도구입니다 이 요구 사항 : 있습니다. ...

Murka 사용자가 쉽게 단순히 중간 네트워크를 사용하여, 계통 문제를 해결하는 데 도움이 무료, 크로스 플랫폼 오픈 소스 명령 줄 소프트웨어입니다. 그것은 경험적 방법, 정확한 알고리즘뿐만 아니라 스타이너 문제 해결사가 포함되어 있습니다.Murka 했음; S 입력은 가역과 정렬 stepmatrix, 출력 즈 (부) 최적 나무 및 이들의 여러 조합을 제공한다. 이 소프트웨어는 리눅스 및 Microsoft Windows 운영 체제 모두에서...

HTSeq 처리하고 높은 처리량 시퀀싱 데이터 (HTS) 분석을 분석하는 파이썬 프레임 워크입니다 이 요구 사항 : 있습니다. ...

. 오렌지 - 생물 정보학은 오렌지 데이터 마이닝 소프트웨어 패키지 추가에 & NBSP이다 그것은 생물 정보학의 기본 작업에 대한 일반적인 기능을 제공함으로써 오렌지를 확장합니다. 또한 마이크로 어레이 및 게놈 데이터 흐름을 관리하고 그들의 요구에 맞게 일반적인 데이터 분석 도구를 결합하여 자신의 분석을 사용자 정의 할 수 프로그래머가 아닌 사용자를 활성화 오렌지 캔버스에 대한 위젯을 제공합니다.문서는에서 발견된다...

edittag은 플랫폼 별 시퀀싱 어댑터와 PCR 프라이머로 서열 태그를 편집 메트릭 시퀀스 태그 세트를 디자인 편집 메트릭 형태에 대한 일련의 태그를 확인하고, 통합에 대한 응용 프로그램 모음입니다. edittag는 다른 접근 방식과 다릅니다& NBSP; * edittag 멀티 프로세싱을 사용하여 적절한 시간 프레임 편집 - 메트릭 시퀀스 태그의 임의의 길이를 생성& NBSP; * edittag 편집 메트릭 시퀀스 태그 세트를 선택한 편집 거리를 준수...

VULCAN 프로젝트는 전산 유체 역학 분석을 제공합니다.VULCAN (복잡한 흐름 분석을위한 점성 맞바람 알고리즘은) 극 초음속 난류 반응과 직렬 및 병렬 컴퓨팅 플랫폼의 다양한 흐름을 비 반응을 통해 아음속 속도에 대한 전산 유체 역학을 제공합니다.추진 유동 해석의 계산량은 타원과 공간 마칭 스킴 특수 난류 벽먼트, 멀티 그리드 방법의 사용을 통해 감소되고, 조절의 지배 방정식은 수치 강성을 감소.물리적 모델링 기능은 압축성, 레이놀즈 응력 이방성,...

seriesoftubes는 Solexa 칩 서열 데이터에 대한 확장 파이프 라인이다.패키지 문서 요구 사항 :...

reciprocal_smallest_distance 글로벌 서열 정렬과 시퀀스 사이의 최대 우도 진화 거리를 정확하게 게놈 사이의 orthologs를 감지 할 수를 사용하는 페어 orthology 알고리즘입니다.타르볼에서 설치다운로드 GitHub의에서 최신 버전의 압축을 풉니 다CD ~컬 -L...

메이크업 등의 시스템을 구축 자주 예를 들어 복잡한 워크 플로우를 생성하는 데 사용됩니다 . 생물 정보학 & NBSP에, snakemake 함께 빠르고 편안하게 실행 환경, 파이썬 스타일의 깨끗하고 현대적인 도메인 특정 사양 언어 (DSL)를 제공하여 워크 플로를 만들 수의 복잡성을 감소시키기 위하여 제정되었습니다.설치- 우분투 12.04에, 당신은 우리의 런치 패드 저장소에 사용할 수있는 데비안 패키지 python3-snakemake를 설치할 수...