Malign

Malign 2.8

악성 구현 다중 정렬 절차는 최소 길이의 분지도를 검색하는 데 사용 된 것과 근접 평행하다. 논리와 프로그램 명령은 Hennig86, NONA 및 PAUP 같은 프로그램에 익숙한 명확하게 알 수있을 것입니다. 정렬 토폴로지는 다른 시퀀스를 통해 구성 및 지점 교환을 통해 향상된다. 얼라인먼트 토폴로지는 다수의 정렬을 수득 분지도 및 그 배열로 구성된다. 가장 인색 분지도 (cladogram)의 비용은 다음 여러 정렬 비용으로...

POY

POY 4.1.2

POY는 데이터 (예 : 형태, 뉴클레오티드, 유전자와 유전자 영역, 염색체, 및 전체 게놈)의 여러 가지를 지원 계​​통 해석 프로그램이다. 입력 시퀀스 prealigned 할 필요가 없습니다 즉 그것이 사실 정렬 및 계통 발생 추론을 수행 할 수 있다는 점에서 POY 특히입니다. 삽입, 삭제 및 재구성이 후, 최대 간결 미만, 또는 최우 아래 모델 트리 전체 점수에 포함될 수있다. 휴리스틱 알고리즘의 다양성은 이러한 목적을 위해 개발되어 POY에서...