POY

POY 4.1.2

POY는 데이터 (예 : 형태, 뉴클레오티드, 유전자와 유전자 영역, 염색체, 및 전체 게놈)의 여러 가지를 지원 계​​통 해석 프로그램이다. 입력 시퀀스 prealigned 할 필요가 없습니다 즉 그것이 사실 정렬 및 계통 발생 추론을 수행 할 수 있다는 점에서 POY 특히입니다. 삽입, 삭제 및 재구성이 후, 최대 간결 미만, 또는 최우 아래 모델 트리 전체 점수에 포함될 수있다. 휴리스틱 알고리즘의 다양성은 이러한 목적을 위해 개발되어 POY에서...

Malign

Malign 2.8

악성 구현 다중 정렬 절차는 최소 길이의 분지도를 검색하는 데 사용 된 것과 근접 평행하다. 논리와 프로그램 명령은 Hennig86, NONA 및 PAUP 같은 프로그램에 익숙한 명확하게 알 수있을 것입니다. 정렬 토폴로지는 다른 시퀀스를 통해 구성 및 지점 교환을 통해 향상된다. 얼라인먼트 토폴로지는 다수의 정렬을 수득 분지도 및 그 배열로 구성된다. 가장 인색 분지도 (cladogram)의 비용은 다음 여러 정렬 비용으로...