Expression2Kinases

게놈 전체 mRNA의 프로파일 링은 서로 다른 조건에서 세포의 글로벌 상태의 스냅 샷을 제공합니다. 그러나 mRNA 수준 상류 규제 메커니즘 직접 이해를 제공하지 않는다. Expression2Kinases (X2K)는 게놈 전체 유전자 발현에 관측 된 변화에 대한 가능성이 책임 상류 규제를 식별 할 수있는 새로운 방법입니다. 칩 SEQ / 칩 위치 가중치 행렬 (PWM의) 데이터, 단백질 - 단백질 상호 작용, 및 키나제 기질의 인산화 반응을 통합함으로써 X2K 유전자 발현에서 게놈 전반에 걸친 차이의 상류 규제기구를 식별하는 데 사용될 수있다. 아이디어는 제 유전자 발현의 차이를 조절하는 가장 가능성있는 전사 인자를 추론하고, 이들 인자를 중심으로 전사 조절 서브 네트워크를 구축하기위한 추가의 단백질을 사용하여 식별 된 전사 인자를 연결하는 단백질 - 단백질 상호 작용을 사용하여, 최종적 키나제 기판을 사용 단백질 인산화 반응은, 식별 가능성 식별 전사 복합체의 형성을 조절하는 랭크 후보 단백질 키나제. X2K 또한 농축 분석 유전자 목록을 수행하고 역 또는 유전자 발현의 변화를 악화시킬 수있는 약물을 예측하는 도구가 포함되어 있습니다. X2K 접근 행동의 세포 신호 및 해명 약물 메커니​​즘에 대한 우리의 이해를 발전 할 수 있습니다

요구 사항 : 있습니다.

자바 런타임 환경 6.0