새로운 소프트웨어 에 Mount Sinai School of Medicine Ma'ayan

생체 분자는 노드로 표현하고 상호 작용이 링크로 표시되는 그래프 (네트워크)와 같은 보기 단백질 - 단백질과 리간드 - 단백질 상호 작용은, 분자 메커니즘의 체계적인 이해를 달성하기 위해 서로 다른 소스에서 실험 결과를 통합하기위한 유망한 접근법이다 세포 표현형을 운전. 이러한 네트워크의 시각화 도전 나타낸다 대규모 시그널링 네트워크의 출현은, 위상 통계 분석을위한 기회를 제공한다. SAVI 네트워크 모티프의 클러스터링, 연결 유통 및 탐지뿐만 아니라...

Genes2Networks는 배경 포유류 signalome 및 interactome 네트워크의 컨텍스트에서 포유 동물 유전자의리스트를 배치하는데 사용될 수있는 명령 줄 소프트웨어입니다. 프로그램에 대한 입력이 인간의 목록 Entrez의 유전자 유전자 심벌 및 SIG 형식 배경 네트워크 출력 포함하면서 : 유전자 / 단백질 식별 된 모든 상호 작용, 중간 부품의 특이성 순위 유전자를 연결하기 위해 사용되는 중간 구성 요소를 사용하여 유전자 / 단백질을...

연구 간행물의 볼륨이 PubMed에에 인간의 지식 기반에 매일 추가 압도적이다. 가장 최근의 연구를 최신 상태로 유지하는 것은 과학자의 성공을 위해 중요하다. PubMedAlertMe 사용자가 최신 자신이 좋아하는 PubMed를 쿼리에 유지하는 데 도움이 될 수 있습니다. 이 프로그램은 매일 또는 매주 중 하나를 실행 할 예정이다. 프로그램의 검색 엔진 PubMed를 게시 새로 출판 된 논문을 발견하면 가 , 그것은 새로운 논문에 대한 링크의 목록을...

게놈 전체 mRNA의 프로파일 링은 서로 다른 조건에서 세포의 글로벌 상태의 스냅 샷을 제공합니다. 그러나 mRNA 수준 상류 규제 메커니즘 직접 이해를 제공하지 않는다. Expression2Kinases (X2K)는 게놈 전체 유전자 발현에 관측 된 변화에 대한 가능성이 책임 상류 규제를 식별 할 수있는 새로운 방법입니다. 칩 SEQ / 칩 위치 가중치 행렬 (PWM의) 데이터, 단백질 - 단백질 상호 작용, 및 키나제 기질의 인산화 반응을...

GATE (시계열 표현의 그리드 분석) 높은 차원의 바이오 분자 시계열의 분석 및 시각화를위한 통합 전산 소프트웨어 플랫폼입니다. GATE는 할당 된 시스템 레벨 분자에게 애니메이션 동영상을 생성하기 위해, 분자량 성분의 발현 량에 따른 이차원 육방 배열 분자 시계열을 정렬 동적 색 개별 육각형하는 상관 관계 기반 클러스터링 알고리즘을 사용하여 규제 역학. 상관 관계의 패턴에서 잠재적 인 규제 제어 메커니즘을 추론하기 위해, GATE는 또한 사전 지식...