ZOOM Lite

소프트웨어 스크린 샷:
ZOOM Lite
소프트웨어 정보:
버전: 1.5
업로드 날짜: 28 May 15
라이센스: 무료
인기: 116
크기: 42788 Kb

Rating: 2.0/5 (Total Votes: 2)

ZOOM Lite는 차세대 시퀀싱 데이터 매핑 및 시각화 소프트웨어이다. 같은 사용자 입력 기준 게놈과 일루미나 / Solexa 짧은 파일을 읽거나 AB 단색 공간이 다양한 형식으로 파일을 읽고, * .fasta, * .fastq, * _seq.txt는 * .csfasta 등 줌이 짧은 매핑 결과를 출력 레퍼런스 시퀀스에 판독한다. 줌 라이트는 새롭게 디자인 된 여러 간격 씨의 이론을 바탕으로 빠르고 정확한 매핑 커널을 가지고있다. 240bp로 15bp가 처리 할 수​​에서 모두 단일 엔드 페어링 엔드는 다양한 길이의 읽습니다. 불일치 판독 및 기준 서열에 목표 영역 사이의 다양한 길이의 하나의 삽입 / 삭제 임의의 수의 허용된다. 각 읽기 고유 매핑 결과 또는 최고 (최고 N) 결과는 최소한의 불일치 및 INDEL의 길이에 따라보고됩니다. 품질 점수는 매핑의 정확성을 향상시키기 위해 이용된다. 매핑 커널 기반, ZOOM Lite는, 사용자가 로컬 판독 데이터 및 레퍼런스 시퀀스 데이터를로드 최대 네 개의 CPU 사이에서 병렬로 적절한 파라미터, 프로세스 대용량 데이터를 선택, 주행 작업을 모니터링 매핑 결과를 저장할 수의 그래프를 볼 중 하나에 매핑 결과를 출력 매핑 결과 * .BED 또는 추가 UCSC 브라우저 트랙 정보와 조사에 대한 * .GFF 파일 형식. 매핑 결과 판독 사이 상세한 서열 정렬에 전체 염색체상에서 판독 깊이 그래프로부터, 임의의 원하는 크기로 볼과 레퍼런스 시퀀스 될 수있다. 사용자는 쉽게 간단하게 클릭 및 드래그하거나 스크롤을 통해 관심 지역으로 이동합니다. 줌 라이트 줌 Studio 소프트웨어의 파생

이 릴리스의 새로운 기능 : 있습니다.

버전 1.5 SAM 내보내기 형식, 구조 조정, 더 나은 코드 최적화, 작은 프로그램 바이너리 크기 및 업그레이드 dabase를 포함 성능 향상을 위해 engining.

지원되는 운영 시스템

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