PathVisio

PathVisio는 경로를 그릴 수 system.Can GNU / 리눅스 운영에서 생물학적 경로를 표시하는 분석 및 편집에 사용되는 지상 최대 Java 프로그램 언어로 구현 및 설계 오픈 소스와 완전히 무료 그래픽 응용 프로그램입니다 ,, 생물학적 entitiesThe 소프트웨어는 경로를 그릴 사용자 수 있습니다 링크 생물학적 데이터에 생명체 (단백질 또는 유전자)를 연결, 데이터베이스 식별자, 편집 경로를 사용하여뿐만 아니라 경로를 분석합니다. PathVisio으로 당신은 또한 마이크로 어레이 데이터와 실험 데이터를 매핑하고 기존 경로 도면의 상단에 시각화 할 수 있습니다.
또한, 당신은, 유전자 데이터베이스를 선택 대사 데이터베이스를 선택할 수 있습니다, 통계, 수입 발현 데이터, 선택 식 데이터 세트, 검색 경로,보기 전설을 보려면, 객체, 수입 프로젝트를 조작뿐만 아니라 설치하고 플러그인을 관리하기 위해, 이는 더 installationThe 응용 프로그램이 당신의 GNU / Linux 운영 체제에 설치하지 않고 사용할 수 없습니다 app.Requires에 추가 기능을 추가 할 수 있습니다. 당신이 할 일은, Softoware의 이진 패키지를 다운로드하여 원하는 위치에 아카이브를 저장, 보관 관리자 유틸리티를 사용하여 추출, 추출 된 디렉토리를 엽니 다, 그리고 hoodWhile file.Under pathvisio.jar 더블 클릭 PathVisio 소프트웨어의 후드 아래 빠른 살펴 본다, 우리 및 다른 URL는, 응용 프로그램이 Java 프로그램 언어로 작성되어 있는지 그래픽 사용자 인터페이스는 최신 자바 스윙 기술로 설계되어 있음을 발견했습니다. 우리 및 다른 URL는, 성공적으로 자바는 자바 프로그래밍 언어로 작성된 supportedBeing되는 모든 OS에서 32 비트 또는 64 비트 CPU의 architectures.Runs 중 하나를 지원하는 컴퓨터에서 응용 프로그램을 테스트했습니다, PathVisio는 GNU / 리눅스를 지원하는 플랫폼에 독립적 인 응용 프로그램을 선언 할 수 있습니다 마이크로 소프트 윈도우, 맥 OS X, BSD, Solaris 및 최신 자바 기술을 지원하는 다른 운영 체제

이 릴리스의 새로운 기능입니다 무엇 : 있습니다.

2014년 1월 31일 : 버그 수정 릴리스
GeneOntology의 용어는 이제 주석에 대한 검색 결과에서 제거
DataNodes는 ID와 데이터 소스 또는 아무것도 주석해야 (만 ID 또는 데이터 소스와 데이터 노드를 저장하면 더 이상 허용되지 않습니다)

이 버전 3.1.2의 새로운 기능 : 파일 가져 오기 모듈

이 주요 버그가 수정 : http://developers.pathvisio.org/ticket/1697

이 버전 2.0.11의 새로운 기능 :

이 자동 저장
스크롤 휠을 사용하여 확대
라인의 선택은 쉽게하지 : 더 이상 필요가 정확한 픽셀을 클릭
이제 오버 표현 분석을위한 두 가지 방법으로; 하나의 경로를 지향하고 하나의 데이터 지향

이 버전 2.0.10의 새로운 기능 : 도면의

이 새로운 방법은 효과를 스트레칭 피하기 위해 모서리가 둥근 사각형
다양한 작은 버그 수정

이 버전 2.0.9의 새로운 기능 :

이 임의의 길이와 임의의 각도의 커넥터를위한 새로운 커넥터 유형
새로운 & quot; 세포 구성 요소 & quot; 구획의 생물학적 의미를 기억하는 속성
새로운 & quot; 더블 & quot; 라인 타입 (더블 membraned 세포 소기관에 특히 유용합니다)
경로의 클릭 가능한 하이퍼 링크
이정표 참조 : & quot을, milestone_27 & quot을; 버그 수정의 전체 목록

이 버전 2.0.8의 새로운 기능 :

이 세포의 구성 요소에 대한 개선 된 모양
같은 팝업 메뉴에 복사 / 붙여 넣기와 같은 몇 가지 사용성 개선
이정표 참조 : & quot을, milestone_26 & quot을; 버그 수정의 전체 목록

이 버전 2.0.7의 새로운 기능 :

이 도구 모음 아이콘과 새로운 사이드 패널을 쉽게 화살표 형태와 모양을 선택 할 수 있도록 (감사 liubing)
다른 하나의 경로에서 링크를 추가 할 수 있도록 통로 데이터베이스, 데이터 소스로 포함되어 있습니다
BioPAX 컨버터는 개선 이상의 유효한 BioPAX 문서를 생산하고있다.
각각의 포인트가 조작 할 수있는 새로운 커넥터 타입 (감사 leonth)
데이터 소스의 수는 180 이상으로 증가 된
이정표 참조 : & quot을, milestone_25 & quot을; 버그 수정의 전체 목록

이 버전 2.0.6의 새로운 기능 :

이 모양에 앵커의 수는 기본 12에서 증가 될 수있다.
데이터 시각화의 전설은 이제 통로 이미지 자체에 표시 할 수 있습니다. 이전에는 측면 패널에서만 볼 수 있었다.
이정표 참조 : & quot을, milestone_24 & quot을; 버그 수정의 전체 목록

이 버전 2.0.4의 새로운 기능 : 모양, 라벨 및 datanodes의

이 개선 된 텍스트 서식
datanodes에 대한 더 많은 모양
간단한 픽셀 좌표
datanodes에 세트 배경색

이 버전 2.0.3의 새로운 기능 :

이 릴리스의 가장 주목할만한 GPML 경로 형식 (버전 2010A)에 대한 새로운 XML 스키마입니다. 이 새로운 경로의 형식은 다음 릴리스에서 나타나는 사람들의 일부 기대할 수 많은 새로운 그래픽 기능을 미래를 가능하게 할 것이다.
기타 새로운 기능 :
보이지 않는 앵커 뭔가가 그들에 연결되어 적어도 때, 정말 보이지 않는 (마고에게 감사)
추가 -v 명령 행 옵션 (마크 덕분에)
현재 선택된 데이터베이스가 다시 상태 표시 줄에 제대로 표시
개발자 플러그인에 대한 많은 새로운 확장 점
이정표 참조 : & quot을, milestone_21 & quot을; 버그 수정의 전체 목록

2.0.1 버전의 새로운 기능 : 앵커를 가리 자동 커넥터

이 개선 알고리즘.
짧은 & quot를 화살표 유형의 향상된 그리기; 갭 & quot; 끝에.
Thawte에 freemail 서비스가 취소 되었기 때문에, 우리는 우리의 보안 인증서를 업데이트
통로 역사 뷰어는 그렇지 않은 경우에도, 각 행이 수정 간주 버그를했다. 이 문제는 해결되었습니다.

이 요구 사항 :

이 오라클 자바 스탠다드 에디션 런타임 환경