MacMolPlt

MacMolPlt 전산 화학 실행의 결과를 통합 그래픽 모델 빌더 분자를 구축 만들 입력 파일 GAMESS 전산 화학 프로그램하고 시각화하기 위해 사용될 수있는 화학 시각화 툴이다. 기능은 고품질의 3D 디스플레이, 고품질 이미지 및 플래시 퀵타임 무비 비롯한 다양한 포맷 정상 모드와 반응 순서 및 출력의 애니메이션을 포함한다.

입력 사용 : MolPlt 파일 형식은 어떤 GAMESS 또는 가우스 로그 파일에서 직교 좌표에 붙여 GAMESS에 의해 펀칭 어떤 GAMESS 입력, 로그인하거나 IRC 파일 Xmol 스타일 XYZ 파일 MolDen 형식의 파일 단백질 데이터 은행 (PDB) 화학 마크 업 언어 (CML) 파일 구조의 직교 또는 Z-매트릭스 스타일의 내부 좌표 3D 디스플레이와 일반 모드 일반 모드 애니메이션을 사용하여 손으로 빌드 대화 형 분자 편집기를 사용하여 그래픽으로 빌드 파일. 모든 Z 매트릭스 파라미터 측정 시각 / 표시 거리, 각도 및 dihedrals 마우스의 제어하에 계산 된 3D 실시간 회전 및 병진. 선형 최소 모션 (LLM) 경로 2D 및 3D 계산 및 표시의 자동 생성 : 분자 오비탈 (AO의, MO의, 또는 LMO의) 총 전자 밀도 밀도 차이 분자 정전기 전위 (MEPMaps) GAMESS는 OpenGL이 사용에 대한 기본 입력 파일 생성 높은 대칭 따라 원자는 자동으로 대칭 고유의 원자를 결정 좌표의 집합에 대한 지원 포인트 그룹의 목록을 결정 생성 분자 대칭에 대한 품질의 3D 렌더링을 지원합니다. 회전 많은 포인트 그룹 공개 출력 품질을 직접 인쇄를 통해 또는 복사하여 다른 응용 프로그램에 붙여 넣기 (흑백 또는 컬러)에 대한 적절한 원칙 방향 표시 대칭 사업자로 조정합니다. 윈도우 비트 맵, JPEG, PNG, CML, XMol XYZ, MDL의 molfile, POV - 레이, 플래시 동영상 및 QuickTime 동영상을 포함한 다양한 형태의 출력.

이 릴리스의 새로운 기능입니다 무엇 :

이 몇 가지 향상된 기능은 디스플레이 코드되었습니다. 옵션와 그림자없이 부드러운 음영에 prefernces의 3D 창에 추가되었습니다.
MOPAC 파일에 대한 기본적인 지원을 추가했습니다.
AB 론적, MM 및 EFP 원자의 가시성을 전환하는 옵션을 추가했습니다.
모델 코어 잠재력에 대한 지원이 향상되었습니다.
새로운 GAMESSQ 프로그램의 입력 빌더에 후크를 추가했습니다.
PDB 파일 파서을 개선.