LSim는 거대 분자의 전자 밀도를 중첩과 구조적 유사성 점수를 계산한다. 그 계산은 분자의 크기가 비교되는 선형 적으로 확장.
LSim 정렬은 생화학 적 구조 요소 개념적으로 관련이없는, 따라서, 구조 전용 단백질 유사성 연구에 대한 편견과 적합하다.
설치 :
배포 파일의 압축을 풉니 다 :
타르 -xzvf lsim-linux.tar.gz
파일 디렉토리로 이동 :
CD의 lsim.1.0.0
복사, 이동 또는 적절한 위치에 실행 파일 lsim 연결 - 그리고 확인 lsim을 PATH 환경 가변, 예를 통해 액세스 할 수 있습니다 :
CP의 lsim은 / usr / local / bin에
선택한 LSim 디렉토리, 예를 가리 키도록 변수 LSIMDIR를 설정합니다 :
에서는 setenv LSIMDIR /home/olaguer/progs/lsim.1.0.0
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