InDelFixer 차세대 시퀀싱 데이터로부터 삽입 또는 삭제를 야기 프레임 시프트를 제거하는 자바 프로그램이다. 경우에 따라서는 원하는 단백질이 프레임 시프트와의 변형이없는 것으로 알려져있다. 이 프레임 이동은 주어진 참조 게놈 (또는 이후 버전에서 여러 정렬)으로 보정 할 수있다. 이 프로그램은 FASTQ 파일로 표준 흐름 그램 형식의 파일, FASTA / PacBio의 CCS 파일 및 일루미나 쌍 엔드 데이터를 받아 이 요구 사항 : 있습니다. ...

QuasiRecomb Quasispecies 바이러스를 생성 마르코프 모델을 시뮬레이션 명령 콘솔에서 실행 경량 애플리케이션이다. 이는 차세대 시퀀싱 데이터를 분석하여 그 파라미터를 추론하는 바이러스 quasispecies 및 방법의 발전을 설명한다. 이 모델은 명시 적으로 고려 재조합 과정을 복용의 장점을 보여주는 시뮬레이션 데이터 검증 및 실험 HIV 샘플에서 얻은 읽기에 적용하여 시험한다. 그것은 quasispecies에 바이러스 균주의 분포를...

SASfit

SASfit 0.93.4

SASfit 특별히 당신에게 작은 각도로 산란 데이터에 피팅 구조 모델에 대한 프로그램을 제공하도록 설계된, 간단 편리하고 사용하기 매우 쉬운 응용 프로그램입니다. 그것은 선회 반경, 불변 산란 및 Porod 상수와 같은 중요한 구조 매개 변수를 계산할 수 있습니다. 그것은 다른 구조 요인 등 여러 가지 폼 팩터와 함께 크기 분포에 맞게 할 수 있습니다. 또한 동시에 알고리즘 파라미터들의 공통적 인 여러 산란 커브에 맞게 할 수있는 구현되었다. 글로벌...

MassWiz

MassWiz 1.7.4.1

MassWiz은 FDR 기반의 통합 목표 미끼와 오픈 소스 MS / MS 알고리즘이다. 그것은 탠덤 질량 분석 데이터로부터 단백질 식별에 도움이됩니다. 그것은 단백질 체학 (proteomics), 질량 분석, 목표 미끼 검색, FDR 계산, 특이도, 알고리즘 및 감도를...

SketchEl

SketchEl 1.56

SketchEl 공구 및 분자 스프레드 시트 데이터 엔트리 애플리케이션을 스케치 대화식 화학 분자이다. 스케 분자에 의해 제공되는 기능 세트는 주로 편리한 작은 분자 구조의 다이어그램 표현을 수정하는 데 필요한 최소한의 기능으로 제한된다. 도구 모음, 템플릿, 마우스 제스처, 키보드 단축키, 유틸리티 명령 및 여러 가지보기 모드는 가능한 한이 편리하게하기 위해 제공됩니다. 분자가 쉽게 편재 MDL MOL 파일 형식으로 상호 전환 될 수있다. 분자...

PoseView

PoseView 1.1.2

PoseView 원시 PDB 파일 구조로 데이터를 제공함으로써 2 차원 다이어그램을 생성 할 수 있고, 소형 공구. 입력은 결정 구조로부터 직접 올 수 또는 도킹 프로그램 예에 대해 계산 될. 출력은 GUI 시각화 또는 PNG-, PDF-, 또는 XFIG 파일로 내보낼 수 있습니다. 이 PoseView 또는 직관적 인 그래픽 유저 인터페이스를 통해 복수의 데이터의 높은 처리량에 대한 처리 명령 라인에 이용 될...

FlexNovo

FlexNovo 1.6.3

FlexNovo 점진적으로 활성 부위에 리간드를 구성 FLEXX 기술에 기초하여 새로운 분자 설계 프로그램이다. 이 타겟 트의 3 차원 구조의 맥락에서 디자인 드 노보 프래그먼트 기반 접근을 용이하게한다. 그것은 통합 및 사용자 정의 아이디어 창출 시스템이 될 것을 의미한다. 이 리드 인 프로토 타입 라이브러리를 설계하고, 표적 단백질에 대한 신규 골격뿐만 아니라 대안적인 결합 모드를 제안하는데, 새로운 구조적 모티프를 제안한다. 또한 활성 부위의 깊이...

MoSS

MoSS 6.10

모스 분자 설명의 데이터베이스 빈번한 분자 하부 구조를 찾는 과정이다. 알고리즘은 빈번한 아이템 세트 마이닝 에끌라 알고리즘을 기반으로합니다. 그렇다 기본 이끼 / 외무성 알고리즘에서,이 프로그램이 특수 처리 모드로 gSpan 알고리즘을 포함하고...