공간 오버랩 평가자는 사용자가 쌍 현명한 공간 거리에 따라 개인의 두 그룹의 공간 중첩을 평가하는 데 도움이 할 수있는 접근 도구로 개발되고있다. 그것은 다른 서식지에서 두 개의 마우스 여우 원숭이 종의 공간 중첩의 차이를 공개하고 정량화하는 인구 유전 연구에 사용되었다. 이것은 가장 가까운 이웃의 정의 된 횟수 내에서 기 할당 1/2 개인의 평균 수를 계산한다. 결과 값은 두 개의 서로 다른 그룹의 공간적 중첩의 정도를...
InDelFixer 0.9
InDelFixer 차세대 시퀀싱 데이터로부터 삽입 또는 삭제를 야기 프레임 시프트를 제거하는 자바 프로그램이다. 경우에 따라서는 원하는 단백질이 프레임 시프트와의 변형이없는 것으로 알려져있다. 이 프레임 이동은 주어진 참조 게놈 (또는 이후 버전에서 여러 정렬)으로 보정 할 수있다. 이 프로그램은 FASTQ 파일로 표준 흐름 그램 형식의 파일, FASTA / PacBio의 CCS 파일 및 일루미나 쌍 엔드 데이터를 받아 이 요구 사항 : 있습니다. ...
QuasiRecomb 1.0
QuasiRecomb Quasispecies 바이러스를 생성 마르코프 모델을 시뮬레이션 명령 콘솔에서 실행 경량 애플리케이션이다. 이는 차세대 시퀀싱 데이터를 분석하여 그 파라미터를 추론하는 바이러스 quasispecies 및 방법의 발전을 설명한다. 이 모델은 명시 적으로 고려 재조합 과정을 복용의 장점을 보여주는 시뮬레이션 데이터 검증 및 실험 HIV 샘플에서 얻은 읽기에 적용하여 시험한다. 그것은 quasispecies에 바이러스 균주의 분포를...
MassWiz (64-bit) 1.7.4.1
MassWiz은 FDR 기반의 통합 목표 미끼와 오픈 소스 MS / MS 알고리즘이다. 그것은 탠덤 질량 분석 데이터로부터 단백질 식별에 도움이됩니다. 그것은 단백질 체학 (proteomics), 질량 분석, 목표 미끼 검색, FDR 계산, 특이도, 알고리즘 및 감도를...
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