MultiDendrograms

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MultiDendrograms 만들 수있는 간단하면서도 강력한 응용 프로그램은 실제 오픈 소스 라이센스하에 배포 데이터, & NBSP의 계층 적 클러스터링이며, 거리 (또는 가중치) 매트릭스에서 시작, MultiDendrograms 가장 일반적인 응집성 계층 적 클러스터링 알고리즘을 사용하여 Dendrogram이를 계산 , 그래픽 표현 매개 변수의 많은 튜닝을 허용하고, 그 결과를 쉽게 파일로 내보낼 수 있습니다. 특성의 요약 :
- 멀티 : 자바 개발은, 모든 운영 체제 (예 : 윈도우, 리눅스 및 맥 OS)에서 실행됩니다.
- 그래픽 사용자 인터페이스 : 데이터 선택, 계층 적 클러스터링 옵션 Dendrogram이 표현 파라미터에 걸쳐 탐색 Dendrogram이, 편차 측정.
- 계층 적 클러스터링 알고리즘 구현 : 가변 그룹 단일 링크, 전체 링크, 비가 중 평균, 가중 평균, 비가 중심, 가중 중심과 공동 간 내.
- 표현의 매개 변수 : 크기, 방향, 레이블, 축 등
- 편차 조치 : Cophenetic 상관 계수, 정규화 된 평균 제곱 오류 및 정규화 된 평균 절대 오류가 발생했습니다.
- 수출 : ultrametric 매트릭스, 텍스트 및 Newick 트리 형식으로 Dendrogram이 세부 사항.
- 플롯 : JPG, PNG 및 EPS 형식으로 Dendrogram이 이미지.
MultiDendrograms는 가변 기는 표준 쌍 족 및 알고리즘의 구현에 위치한 비 고유성 문제를 해결하기 위해서는 알고리즘을 구현한다. 다른 클러스터 사이에 두 개 이상의 최소 거리가 합병 과정에서 동일하면이 문제가 발생합니다. 표준 방법은, 한 쌍의 사이의 거리를 선택하는 관계를 깨는 구성되며, 최종 계층 적 분류가 얻어 질 때까지 동일한 방식으로 진행한다. 그러나, 다른 clusterings는 관계 파괴하는 데 사용되는 기준에 따라 가능하다 (일반적으로 한 쌍의 그냥 무작위로 선택됩니다!).
가변 기 알고리즘 기 multidendrogram 불리는 그래픽 표현들에겐 관계가 발생할 동시에 두 개 이상의 클러스터. 그들의 주요 특성은 다음과 같습니다 :
- 아무런 관계가없는 경우, 가변 그룹 알고리즘 쌍 족 것과 동일한 결과를 제공한다.
- 그들은 항상 고유하게 결정 솔루션을 제공합니다.
- 결과에 대한 multidendrogram 표현의 하나는 명시 적 응집성 과정에서 관계의 발생을 관찰 할 수 있습니다. 또한, 모든 융합 간격 (프로그램에서 밴드)의 높이가 해당 클러스터 내부의 이질성의 정도를 나타내는

요구 사항 : 있습니다.

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