cobracommander-졸개 파이썬 응용 프로그램입니다.
Snakefiles
snakefile 구성하고 잡이 빌드를 실행하는 데 사용되는 것입니다. snakefile 너무 오래 그것을 호출 할 때 stdout에 유효한 JSON을 출력으로 임의의 파일이나 실행 파일을 할 수 있습니다.
하나의 키 / 당신의 snakfile에 JSON 수 __must__ 가치가있다;
-`build` : 프로젝트를 빌드하는 데 필요한 단계를 포함하는 문자열의 배열입니다. 이들은 순차적으로 실행됩니다.
그러나 또한 다른 결과를 달성하기 위해 당신의 snakefile에서 설정할 수있는 다른 옵션 속성의 무리가 있습니다, 여기에 몇 가지;
-`environment` : 누구의 키 / 값이 호출되는 모든`build` 단계 이전에 설정해야합니다 환경 변수 객체입니다.
-`hooks` :
& NBSP; -`before_build`
& NBSP; -`after_build`
& NBSP; -`after_passing`
& NBSP; -`after_failing`
확장 (미래의 사양에 대한 참고)
확장은 일반적으로 그들이 제공하는 기능에 따라 다른 맛의 무리에 온다.
확장 빌드 프로세스 내에서 특정 등록 지점에서 여분의 능력과 기능을 추가 할 수 있습니다 (예를 들어, 포스트 빌드 등 후크, 중)
확장은 같은 snakefile에 전달 될 수있는 등록 포인트에서 호출되기 전에 구성이나 PARAMS을 필요로하는 경우;
& NBSP; & nbsp; & nbsp; 확인 '후크'{
& NBSP; & NBSP; & NBSP; & nbsp; & nbsp; 확인 'before_build':
& NBSP; & NBSP; & nbsp; & nbsp; 확인 & NBSP; & nbsp; & nbsp; 확인 [ 'my_extension'[ '인수'], { 'kwargs로': '갑'}],
& NBSP; & NBSP; & nbsp; & nbsp; 확인 & NBSP; & nbsp; & nbsp; 확인 [ 'my_other_extension'[ '인수']],
& NBSP; & NBSP; & nbsp; & nbsp; 확인 & NBSP; & nbsp; & nbsp; 확인 [ '등']
& NBSP; & NBSP; & NBSP; & nbsp; & nbsp; 확인 ]
& NBSP; & nbsp; & nbsp; 확인 }
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