Adun

Adun 0.8.2

Adun 프로젝트 데이터 관리 및 분석 기능을 포함하는 확장 가능한 생체 분자 시뮬레이션 프로그램이다.Adun은 직관적 인 사용자 인터페이스뿐만 아니라,보다 유연한 프로그래밍 수준에서 액세스 할 수있는 분자 시뮬레이션을위한 고급 알고리즘 및 프로토콜을 제공합니다. 그것은 생성 및 시뮬레이션을 조작하기위한 강력한 라이브러리입니다 Adun 프레임 워크에 내장되어 있습니다.그러나 그것은을뿐만 아니라 그 능력을 쉽게 확장 할 수 메커니즘을 제공하는 것으로 분석...

AREM

AREM 1.0.1

AREM는 (칩 서열 데이터에 대한 모델 기반 분석) 맥을 기반으로합니다.염색질 면역 침전 (칩 서열)에 결합 높은 처리량 시퀀싱 널리 게놈 전반 전사 인자, 보조 인자, 염색질 개질제 및 다른 DNA 결합 단백질의 결합 패턴을 특징으로 사용된다. 칩 서열 데이터 분석의 주요 단계는 참조 게놈 단편 높은 처리량 시퀀싱로부터 판독 매핑 짧은 읽기 풍부 피크 영역을 식별하는 것이다.몇 가지 방법이 칩 - 서열 분석을 위해 제안되었지만, 대부분의 기존 사내...

정보학 벤치 마크 시스템은 적절한 테스트 프레임 워크, 테스트, 및 데이터를 구축하는 그 시스템의 성능을 조사하기 위해 최종 사용자와 벤더를 사용하려는 시도가있다.무엇을 우리가하려고하는 것은 테스트를위한 프레임 워크, 모든 다운로드 및 시스템 성능의 특정 요소를 조사하는 데 사용할 수 있습니다 테스트의 핵심 세트를 만드는 것입니다.또한,이 시험에 대한 소스는 GPL에 따라 사용할 수 있으며, 아이디어는 쉽게 측정 및 조정 이유로 의미있는 테스트를...

는 버로우즈 - 휠러 얼 라이너 (BWA)는 예컨대 인간 게놈으로 긴 레퍼런스 시퀀스에 대해 상대적으로 짧은 뉴클레오티드 서열 정렬 효율적인 프로그램이다.이 소프트웨어는 두 알고리즘, BWA-짧고 BWA-SW를 구현합니다. 쿼리에 대한 이전의 작품은 200bp보다 짧은 주위 100kbp까지 긴 시퀀스에 대한 후자의 시퀀스.두 알고리즘 모두는 갭 첨부 정렬을한다. 그들은 일반적으로보다 정확하고 빠른 낮은 오류율 쿼리에 있습니다. 자세한 내용은 BWA...

CaPSID

CaPSID 1.4.3

인간 게놈과 transcriptomes 및 특성 조회, 확장 가능한 결과 데이터베이스 및 관리를위한 사용자 친화적 인 웹 기반 소프트웨어 응용 프로그램과 함께 캡시드 (capsid)는 포괄적 인 오픈 소스 병원균 시퀀스 식별 및 NBSP을위한 고성능 연산 파이프 라인을 통합 플랫폼입니다 결과를 시각화.시작하기당신은 파이썬 2.6+ 설치 및 아파치 톰캣 6 이상을 MongoDB의 데이터베이스가 필요합니다. 자세한 내용은 위키 읽기...