열기 바벨는 오픈 소스, 특수 화학 데이터의 다양한 언어를 인식 할 수 있도록 설계 화학 도구 상자의 역할을하도록 설계되어 협업, 무료 멀티 플랫폼 라이브러리 소프트웨어입니다. 그것은 단순히 불리는 제어판에서 & ldquo된다 열기 화학 툴킷 & rdquo;. glanceWith 열기 바벨에서 기능, 사용자, 검색, 분석, 변환 할 수, 화학, 분자 모델링, 생화학,뿐만 아니라 다른 관련 분야에서 데이터를 저장합니다. 그것은 Mol2, SDF / MOL, PDB, XYZ, SMILES 및 CML을 포함한 일반 화학 파일 형식의 넓은 범위를 지원합니다.
또한, 오픈 바벨, 완전한 기능을 갖춘 프로그래머의 툴킷, 화학 MIME 지원을 제공 정규 유연한 원자 / 채권 타이 퍼, 수소 삭제 및 추가, bitvector 클래스, 행렬과 벡터 변환뿐만 아니라, 분자 테스트 suite.Under로 후드와 SMARTS 지원되는 운영 systemsOpen 바벨 C ++ 프로그래밍 언어로 작성된다. 그것은 및 다른 URL, GNU / 리눅스, BSD, 솔라리스, SGI, Microsoft Windows 및 Mac OS X 운영 체제를 지원합니다 SA 진정한 크로스 플랫폼 소프트웨어. 32 비트 및 64 비트 컴퓨터가 공식적으로 this.Getting 모두의 열기 BabelFirst 시작 작성시 지원됩니다, 우리는 강하게의 기본 소프트웨어 저장소에서 미리 빌드 된 바이너리 패키지를 사용하여 열기 바벨을 설치하도록 권장하여 리눅스 배포판. 당신의 GNU / 리눅스 시스템 및 다른 URL 아무튼 경우, Softoware에 제공 아카이브 보편적 인 소스를 사용하여 응용 프로그램을 컴파일하고 설치해야 할 것이다; t는 당신 및 다른 URL이, 그 REPOS에서 열기 바벨 소프트웨어가 있습니다.
, 타르볼 (tar.gz의 아카이브를) 다운로드 원하는 위치에 압축을 풉니 다, 터미널 에뮬레이터를 열고 압축을 푼 폴더로 이동하고 제어판에서 & ldquo 실행;. cmake & rdquo을; (따옴표없이) 명령을 사용하여 프로젝트를 구성 할 수 있습니다. 그런 다음 제어판에서 & ldquo를 실행해야합니다; 확인 & rdquo; 명령은 따옴표없이, 물론, 컴파일합니다. 에서 CMake 도구 전에 위의 지침에 운영 시스템에 설치되어 있는지 확인하십시오
이 릴리스의 새로운 기능 무엇 :.
이 릴리스 나타내는 중요한 버그 수정 릴리스 강하게 열기 바벨의 모든 사용자에게 권장 안정적인 업그레이드해야합니다. 많은 버그 및 개선 사항은 2.3.0 릴리스 이후 작년에 추가되었습니다.
이 버전 2.2.2의 새로운 기능 :
이 릴리스의 주요 버그 수정 릴리스를 나타내며 강하게 열기 바벨의 모든 사용자에게 권장 안정적인 업그레이드입니다. 많은 새로운 기능이 없을 수도 있지만, 많은 충돌과 다른 버그는 2.2.1 이후에 수정 된.
표준화 된 InChI 및 InChIKey 출력을 생성하기 위해 새로운 InChI 1.02 버전으로 업그레이드.
SMILES을 읽기 / 쓰기 할 때 많은 입체 오류를 수정했습니다. 이는 2.3 릴리스에서 완료 될 큰 프로젝트의 일부입니다.
Cygwin에서와는 MinGW 플랫폼에 고정 컴파일과 설치.
크게 개선 방향성과 Kekule 결합 할당.
개선 된 2D -있다 세대 좌표 3D
--gen3d 명령 줄 작업을 사용하여 세대 좌표 개선
세대 좌표를위한 향상된 성능을 제공합니다.
바벨을위한 새로운 --fillUC 명령 줄 작업.
pH에 따라 수소 첨가에 수정.
Molden, Molpro 및 NWChem 출력 파일에서 진동 데이터를 읽고에 대한 지원이 추가되었습니다.
최근의 이론적 인 계산에서 업데이트 된 원자 반지름.
gzip으로 압축 Mol2 또는 XML 파일을 읽을 때 버그가 수정되었습니다.
오류 후 닫기 파일. 파일이 열려 것이다 Pybel 버그를 수정합니다.
더 많은 버그 수정 및 작은 기능 개선. == 새로운 파일 형식 == 가져 오기 및 내보내기 :
Molpro 입력 및 출력.
VASP 파일 (CONTCAR 및 POSCAR)를 좌표입니다.
이 버전 2.2.1의 새로운 기능 :
이 파이썬 3 지원 및 향상된 자바와 C # 지원을 포함하여 향상된 스크립팅 인터페이스.
MACCS 지문에 대한 지원이 추가되었습니다. RDKit 프로젝트에 감사합니다.
역장 코드에 많은 수정 및 개선. 특히, UFF 역장 구현은 많은 분자를 처리해야합니다.
특히 링 조각으로, 생성 좌표 3D 향상. 이 obgen 유틸리티를 시도 제공 할 수 있습니다.
원자의 종류와 PDB 수입 다양한 오류를 수정했습니다.
PQR 파일 형식에서 요금 및 반경을 읽고에 대한 지원을 추가했습니다.
PDB 형식으로 읽기와 쓰기의 단위 셀에 대한 지원을 추가했습니다.
새로운 & quot; 출력 & quot; 일반 & quot 복용에 대한 파일 형식,이 .out & quot ;, & quot; .LOG '및'.DAT & quot; 파일 및 내용에 따라 적절한 파일 형식과 독서. 현재 양자 화학 패키지에 대해 매우 잘 작동합니다.
파일 형식을로드 할 때없는 향상된 오류 처리 및보고 기능을 추가했습니다.
개선 된 CIF 파일 형식을 지원합니다.
많은, 많은, 많은 추가 버그 수정 및 작은 개선.
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